环保督察整改工作由多级政府和部门共同主管和负责。
党中央：在党中央集中统一领导下，环保督察整改工作得以有序开展。党中央对生态文明建设和生态环境保护工作负有最高领导责任，确保各项决策部署得到有效执行。
中央生态环境保护督察机构：中央生态环境保护督察对省、自治区、直辖市党委和政府，以及国务院有关部门、有关中央企业等履行生态文明建设和生态环境保护责任的组织进行全面督察。这是中央层面对环保督察整改工作的直接主管和负责。
省级政府和相关部门：省、自治区、直辖市生态环境保护督察是中央生态环境保护督察的延伸和补充，对本行政区域内地市级党委和政府、省级政府有关部门、有关省属企业等进行督察。省级政府和相关部门在环保督察整改工作中扮演着重要角色，负责具体执行和推动整改工作。
具体执行层面：如六安市等地，在贯彻落实环保督察整改工作时，明确要求将生态文明建设和生态环境保护工作纳入重要议事日程，定期研究生态环境保护工作，并针对督察指出的问题，逐一明确整改任务、责任等，确保整改工作可操作、可检查、可考核。
职责分工：在环保督察整改工作中，中央生态环境保护督察工作领导小组、中央生态环境保护督察办公室、省级党委和政府、中央和国家机关有关部门等都有明确的职责分工，共同协作确保整改工作的顺利进行。
