在系统的安全性方面，NTFS文件系统具有很多FAT32文件系统所不具备的特点，而且基于NTFS的WIN 2000/XP运行要快于基于FAT32的WIN 2000/XP；而在于WIN 9X的兼容性方面，FAT32优于NTFS。所以在选用哪种文件系统的时候，应该从以下几点考虑：
1，计算机是单一的系统，还是采用多启动的系统；
2，本地安装的磁盘的个数和容量；
3，是否有安全性方面的考虑。
如果要在WIN 2000/XP中使用大于32GB的分区，就选NTFS。
如果作为单机使用，不考虑安全性问题，更多注重与WIN 9X兼容性，就选FAT32。
如果作为网络工作站或对系统有较高的安全性要求而且是单一的系统，建议每个分区都采用NTFS文件系统。
如果要兼容以前的应用，需要安装WIN 9X或其它操作系统，建议WIN 2000/XP采用NTFS文件系统。其它采用FAT32文件系统
NTFS好，但98系统或DOS系统之支持FAT32
还是建议用NTFS
NTFS是随着Windows NT操作系统而产生的，并随着Windows NT4跨入主力分区格式的行列，它的优点是安全性和稳定性极其出色，在使用中不易产生产生文件碎片，NTFS分区对用户权限作出了非常严格的限制，每个用户都只能按着系统赋予的权限进行操作，任何试图越权的操作都将被系统禁止，同时它还提供了容错结构日志，可以将用户的操作全部记录下来，从而保护了系统的安全。但是，NTFS分区格式的兼容性不好，特别是对使用很广泛的Windows 98 SE/Windows ME系统，它们还需借助第三方软件才能对NTFS分区进行操作，Windows 2000，Windows XP基于NT技术，提供完善的NTFS分区格式的支持。
Ntfs的主要特征和优越性：
在NTFS文件系统中，对于不同配置的硬件，实际的文件大小从4GB到64GB。由于NTFS文件系统的开销较大，使用的最小分区应为50MB。
NTFS文件系统与FAT文件系统相比最大的特点是安全性，NTFS提供了服务器或工作站所需的安全保障。在NTFS分区上，支持随机访问控制和拥有权，对共享文件夹无论采用FAT还是NTFS文件系统都可以指定权限，以免受到本地访问或远程访问的影响；对于在计算机上存储文件夹或单个文件，或者是通过连接到共享文件夹访问的用户，都可以指定权限，使每个用户只能按照系统赋予的权限进行操作，充分保护了系统和数据的安全。NTFS使用事务日志自动记录所有文件夹和文件更新，当出现系统损坏和电源故障等问题而引起操作失败后，系统能利用日志文件重做或恢复未成功的操作。主要的作用体现在两个方面：
一、通过NTFS许可保护网络资源
在WindowsNT下，网络资源的本地安全性是通过NTFS许可权限来实现的。在一个格式化为NTFS的分区上，每个文件或者文件夹都可以单独的分配一个许可，这个许可使得这些资源具备更高级别的安全性，用户无论是在本机还是通过远程网络访问设有NTFS许可的资源，都必须具备访问这些资源的权限。
二、使用NTFS对单个文件和文件夹进行压缩
NTFS支持对单个文件或者目录的压缩。这种压缩不同于FAT结构中，对驱动器卷的压缩，其可控性和速度都要比FAT的磁盘压缩要好的多。
除了以上两个主要的特点之外，NTFS文件系统还具有其他的优点，如：对于超过4GB以上的硬盘，使用NTFS分区，可以减少磁盘碎片的数量，大大提高硬盘的利用率；NTFS可以支持的文件大小可以达到64GB，远远大于FAT32下的4GB；支持长文件名等等。
FAT32和NTFS的区别：
1、什么是NTFS－新(N)技术(T)文件(F)系统(S)？
想要了解NTFS，我们首先应该认识一下FAT。FAT(File Allocation Table)是“文件分配表”的意思。对我们来说，它的意义在于对硬盘分区的管理。FAT16、FAT32、NTFS是目前最常
见的三种文件系统。
FAT16：我们以前用的DOS、Windows 95都使用FAT16文件系统，现在常用的Windows 98/2000/ XP等系统均支持FAT16文件系统。它最大可以管理大到2GB的分区，但每个分区最多只能有65525个簇（簇是磁盘空?br />涞呐渲玫ノ唬?K孀庞才袒蚍智?萘康脑龃螅?扛龃厮?嫉目占浣?嚼丛酱螅?佣?贾掠才炭占涞睦朔选?
FAT32：随着大容量硬盘的出现，从Windows 98开始，FAT32开始流行。它是FAT16的增强版本，可以支持大到2TB（2048G的分区。FAT32使用的簇比FAT16小，从
而有效地节约了硬盘空间。
NTFS：微软Windows NT内核的系列操作系统支持的、一个特别为网络和磁盘配额、文件加密等管理安全特性设计的磁盘格式。随着以NT
为内核的Windows 2000/ XP的普及，很多个人用户开始用到了NTFS。NTFS也是以簇为单位来存储数据文件，但NTFS中簇的大小并不依赖于磁
盘或分区的大小。簇尺寸的缩小不但降低了磁盘空间的浪费，还减少了产生磁盘碎片的可能。NTFS支持文件加密管
理功能，可为用户提供更高层次的安全保证。
2、什么系统可以支持NTFS文件系统？
只有Windows NT/2000/XP才能识别NTFS系统，Windows 9x/ Me以及DOS等操作系统都不能支持、识别NTFS格式的磁盘。由于DOS系统不支持NTFS系统，所以最好不要将C:盘制作
为NTFS系统，这样在系统崩溃后便于在DOS系统下修复。
NTFS与操作系统支持情况如下：
FAT16 windows 95/98/me/nt/2000/xp unix，linux，dos
FAT32 windows 95/98/me/2000/xp
NTFS windows nt/2000/xp
3、我们需要NTFS吗？
Windows 2000/XP在文件系统上是向下兼容的，它可以很好地支持FAT16/FAT32和NTFS，其中NTFS是Windows NT/2000/XP专用格式，它能更充分有效地利用磁盘空间、支持文件级压缩、具备更好的文件安全性。如果你只安装Windows 2000/ XP，建议选择NTFS文件系统。如果多重引导系统，则系统盘（C盘）必须为FAT16或FAT32，否则不支持多重引导。?br />比唬?渌?智?奈募?低晨梢晕狈TFS。 c2c78f4s5d4g7
4、如何将FAT分区转换为NTFS？
Windows 2000/XP提供了分区格式转换工具“Convert.exe”。Convert.exe是Windows 2000附带的一个DOS命令行程序，通过这个工具可以直接在不破坏FAT文件系统的前提下，将FAT转换为NTFS。它的?br />梅ê芗虻ィ?仍谧indows 2000环境下切换到DOS命令行窗口，在提示符下键入：D:＼>convert 需要转换的盘符 /FS:NTFS。如系统E盘原来为FAT16/32，现在 需要转换为NTFS，可使用如下格式：D:＼>convert e: /FS:NTFS。所有的转换将在系统重新启动后完成。
